Flying over Natura 2000 es un proyecto destinado al descubrimiento de la red Natura 2000. En él podrá descubrir los emplazamientos de Natura 2000 a través de las migraciones de cigüeñas negras. Así, cada año, estas aves emprenden largas travesías desde Europa hasta sus tierras de hibernación en África. Sus movimientos pueden ser estudiados gracias a un radio transmisor, fijado a la cigüeña como una mini mochila y seguido por satélite. Cada día de su larga travesía, estas cigüeñas envían una postal, o pequeño clip de TV, a los televidentes. En estas postales se muestran los lugares sobre los que han volado, principalmente los emplazamientos de Natura 2000 (o futuros emplazamientos), con sus características, biodiversidad y actividades humanas.